Il sistema di gestione deve contenere tutti gli elementi necessari richiesti dallo schema EFISC-GTP. Ad esempio, la politica e gli obiettivi in materia di sicurezza dei mangimi, la descrizione dei processi, la valutazione dei rischi, la procedura di approvvigionamento e gestione dei fornitori, i registri relativi al controllo della qualità e della sicurezza, il programma di monitoraggio delle materie prime e dei prodotti finiti, la gestione delle non conformità e degli incidenti, nonché i registri relativi alla formazione del personale. L'elenco fornito non è esaustivo, in quanto dipende dai prodotti, dalla natura della produzione/fornitura di servizi e dalla struttura dell'impresa.