System zarządzania powinien zawierać wszystkie niezbędne elementy wymagane przez schemat EFISC-GTP. Na przykład polityka i cele w zakresie bezpieczeństwa pasz, opis procesów, ocena ryzyka, procedura zakupów i zarządzania dostawcami, zapisy dotyczące kontroli jakości i bezpieczeństwa, program monitorowania surowców i gotowych produktów, zarządzanie niezgodnościami i incydentami, a także zapisy dotyczące szkolenia personelu. Powyższa lista nie jest wyczerpująca, ponieważ zależy od produktów, charakteru produkcji/świadczenia usług, struktury przedsiębiorstwa.